MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Lactobacillus brevis KB290 plasmid pKB290-2 DNA

Total Repeats: 188

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_020821	AAC	2	6	29	34	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_020821	AGG	2	6	42	47	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_020821	CG	3	6	1190	1195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_020821	ACA	2	6	1201	1206	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_020821	TAT	2	6	1271	1276	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_020821	TACA	2	8	1305	1312	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_020821	CAAT	3	12	1367	1378	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_020821	ACTTA	2	10	1385	1394	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_020821	A	6	6	1398	1403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_020821	TAC	2	6	1412	1417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_020821	A	6	6	1420	1425	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_020821	TA	3	6	1984	1989	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_020821	T	7	7	2069	2075	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_020821	TAAA	2	8	2111	2118	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_020821	ATG	2	6	2147	2152	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_020821	CTA	2	6	3206	3211	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_020821	TTGG	2	8	3686	3693	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
18	NC_020821	CTA	2	6	3700	3705	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_020821	ATTA	2	8	3748	3755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_020821	AC	3	6	4435	4440	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_020821	AGA	2	6	4484	4489	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_020821	CTT	2	6	4532	4537	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_020821	ATG	2	6	4553	4558	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
24	NC_020821	A	6	6	4618	4623	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_020821	TAG	2	6	6687	6692	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_020821	AGT	2	6	6705	6710	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_020821	ATA	2	6	6778	6783	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_020821	TA	3	6	6908	6913	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_020821	A	6	6	6930	6935	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_020821	T	6	6	6985	6990	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_020821	TAAT	2	8	7639	7646	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_020821	TTA	2	6	7670	7675	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_020821	GA	3	6	7685	7690	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_020821	ATTT	2	8	7692	7699	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_020821	TGT	2	6	7725	7730	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
36	NC_020821	TAC	2	6	7765	7770	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_020821	TAG	2	6	7839	7844	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_020821	A	6	6	7876	7881	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_020821	CTT	2	6	8105	8110	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_020821	ATAG	2	8	8111	8118	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
41	NC_020821	CGC	2	6	8130	8135	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_020821	TA	3	6	8188	8193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_020821	GAC	2	6	8209	8214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_020821	ACCA	2	8	8239	8246	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_020821	TCA	2	6	8265	8270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_020821	TCG	2	6	8310	8315	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_020821	ATA	2	6	9032	9037	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_020821	TA	3	6	9051	9056	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_020821	AAT	2	6	9061	9066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_020821	A	6	6	9122	9127	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_020821	CCT	2	6	9131	9136	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
52	NC_020821	ATG	2	6	9294	9299	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
53	NC_020821	TGA	2	6	9325	9330	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_020821	ACTTT	2	10	10583	10592	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
55	NC_020821	TTGC	2	8	10657	10664	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_020821	AAT	3	9	10674	10682	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_020821	TTTA	2	8	10683	10690	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_020821	ATA	2	6	10759	10764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_020821	AAT	2	6	10786	10791	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_020821	A	7	7	10796	10802	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_020821	ACT	2	6	11163	11168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_020821	GTT	2	6	11199	11204	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_020821	CAA	3	9	11251	11259	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_020821	TTG	2	6	11276	11281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_020821	AGG	2	6	11314	11319	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_020821	TTA	2	6	11328	11333	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_020821	ATA	2	6	11342	11347	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_020821	TTAAA	2	10	12805	12814	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_020821	TAT	2	6	12815	12820	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_020821	AAG	2	6	12836	12841	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_020821	AAT	2	6	12851	12856	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_020821	ACC	2	6	12864	12869	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_020821	GGT	2	6	12892	12897	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_020821	A	6	6	12947	12952	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_020821	A	6	6	13986	13991	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_020821	TTAT	2	8	14042	14049	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
77	NC_020821	ACA	2	6	16183	16188	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
78	NC_020821	ATA	2	6	16224	16229	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_020821	ACA	2	6	16325	16330	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_020821	T	6	6	17366	17371	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_020821	TGA	2	6	17416	17421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_020821	CAA	2	6	17426	17431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_020821	ACT	2	6	17871	17876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_020821	ATA	2	6	17898	17903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_020821	TAT	2	6	18120	18125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_020821	AATA	2	8	18135	18142	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_020821	T	6	6	18207	18212	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_020821	GAG	2	6	18217	18222	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
89	NC_020821	ACT	2	6	19426	19431	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_020821	TTAA	2	8	19457	19464	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_020821	TA	3	6	19474	19479	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_020821	GGA	2	6	19494	19499	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_020821	GGTA	2	8	21105	21112	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_020821	TA	3	6	21158	21163	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_020821	AT	3	6	21234	21239	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_020821	TAA	2	6	21355	21360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_020821	T	6	6	21408	21413	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_020821	ATT	2	6	21524	21529	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_020821	CCTCA	2	10	21545	21554	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
100	NC_020821	TAT	2	6	21599	21604	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_020821	T	6	6	21714	21719	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_020821	TGA	2	6	21748	21753	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_020821	GTT	2	6	21773	21778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
104	NC_020821	TAAT	2	8	21797	21804	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_020821	GTA	2	6	21846	21851	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
106	NC_020821	CCAA	2	8	21859	21866	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_020821	CAC	2	6	22849	22854	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_020821	GTTC	2	8	25022	25029	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_020821	TTCTG	2	10	25058	25067	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
110	NC_020821	T	6	6	25105	25110	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_020821	CTTT	2	8	27194	27201	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_020821	TGT	2	6	27220	27225	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_020821	CAA	2	6	27269	27274	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_020821	TCT	2	6	27319	27324	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_020821	ATT	2	6	27421	27426	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_020821	T	6	6	27987	27992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_020821	AAT	2	6	28180	28185	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_020821	AAT	2	6	28195	28200	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_020821	TAT	2	6	28204	28209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_020821	ATT	2	6	28212	28217	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_020821	ATA	2	6	28266	28271	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_020821	AAT	2	6	28328	28333	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_020821	TTTC	2	8	28363	28370	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
124	NC_020821	TATATT	2	12	28416	28427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_020821	TC	3	6	28455	28460	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_020821	CCCTA	2	10	28632	28641	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
127	NC_020821	AAC	2	6	28656	28661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_020821	TTA	2	6	28667	28672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_020821	CTT	2	6	28711	28716	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_020821	CATTC	2	10	28782	28791	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
131	NC_020821	AAG	2	6	28807	28812	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132	NC_020821	CTT	2	6	28825	28830	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_020821	T	8	8	28840	28847	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_020821	TACC	2	8	28894	28901	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
135	NC_020821	ACA	2	6	28941	28946	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_020821	ACG	2	6	28950	28955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_020821	AC	3	6	28965	28970	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_020821	ATA	2	6	28974	28979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_020821	AAG	2	6	29001	29006	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_020821	TAT	2	6	29378	29383	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_020821	CTG	2	6	29416	29421	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
142	NC_020821	ACG	2	6	29434	29439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_020821	ATTG	2	8	29897	29904	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_020821	A	6	6	29919	29924	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_020821	T	6	6	30006	30011	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_020821	GTC	2	6	30034	30039	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_020821	A	6	6	30103	30108	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_020821	CAG	2	6	30119	30124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
149	NC_020821	TCAC	2	8	30129	30136	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
150	NC_020821	GTTA	2	8	31063	31070	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_020821	AAAAG	2	10	31090	31099	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
152	NC_020821	AAG	2	6	31156	31161	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
153	NC_020821	TTGG	2	8	32113	32120	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
154	NC_020821	CTA	2	6	32127	32132	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
155	NC_020821	ATTA	2	8	32175	32182	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
156	NC_020821	AG	3	6	32246	32251	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
157	NC_020821	ACG	2	6	32303	32308	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
158	NC_020821	CAC	2	6	32356	32361	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
159	NC_020821	ACT	2	6	33671	33676	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
160	NC_020821	T	7	7	33684	33690	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
161	NC_020821	A	6	6	33728	33733	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_020821	CAC	2	6	33742	33747	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
163	NC_020821	TAA	2	6	33759	33764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
164	NC_020821	CTT	2	6	33765	33770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
165	NC_020821	T	6	6	33778	33783	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
166	NC_020821	AAC	2	6	33788	33793	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
167	NC_020821	AC	3	6	33863	33868	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
168	NC_020821	ATA	2	6	33872	33877	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_020821	T	6	6	33882	33887	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_020821	AATTAA	2	12	33946	33957	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_020821	GGC	2	6	34042	34047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
172	NC_020821	ACC	2	6	34060	34065	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
173	NC_020821	A	6	6	34117	34122	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_020821	CTA	3	9	34607	34615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
175	NC_020821	TCG	2	6	34632	34637	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
176	NC_020821	ACC	2	6	34681	34686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
177	NC_020821	CTA	2	6	34718	34723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
178	NC_020821	A	6	6	34723	34728	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
179	NC_020821	TAG	2	6	34734	34739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
180	NC_020821	TGTT	2	8	34760	34767	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
181	NC_020821	ACC	2	6	34811	34816	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
182	NC_020821	CAC	2	6	34845	34850	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
183	NC_020821	TTG	2	6	34869	34874	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
184	NC_020821	TGG	2	6	35028	35033	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
185	NC_020821	T	7	7	35037	35043	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
186	NC_020821	CAA	2	6	35086	35091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
187	NC_020821	T	6	6	35224	35229	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
188	NC_020821	AAC	2	6	35336	35341	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.